济宁市境内资源丰富。全市土地资源面积112.04万公顷，其中耕地面积53.52万公顷。水资源总量平水年为49.98亿立米，其中地表水33.71亿立米，地下水天然补给量16.26亿立米；可利用水资源总量30.37亿立米，其中地表水17.44亿立米，地下水12.93亿立米。天然水资源与可利用水资源的单位面积拥有量、人均占有量均高于全省平均水平。

　　动植物种类繁多。高等植物、蔬菜、林木、花草、药用植物和野生经济植物等总计127科904种。主要农作物有小麦、水稻、玉米、甘薯、棉花，其中被定为山东名产的当地品种有：曲阜香稻、鱼农一号水稻、金谷和泗水小杂豆。畜禽主要有10大类群；鱼类共有8目15科55属82种，其中鲤鱼、鲫鱼科类居多，另有虾、蟹、贝类，分布区主要在微山湖；鸟类201种，微山湖区的水鸟数量居全省首位。

　　矿产资源，已发现和探明储量的有70多种。以煤为主，其次为石灰石、石膏、重晶石、稀土、磷、铁、铜、铅等。济宁市含煤面积3400平方公里，占全市总面积的35%，储量约为254亿吨，主要分布于兖州、曲阜、邹城、济宁、微山等地，为全国重点开发的八大煤炭基地之一。稀土矿位于微山县塘湖乡郗山，地质储量1275万吨，为国内第二大稀土矿。石灰石主要分布在嘉祥、泗水、邹城、曲阜一带，探明储量9亿吨。