德州市跨省大河主要有黄河、卫运河、漳卫新河。跨市的骨干排涝河道有徒骇河、德惠新河和马颊河。以上河流除黄河外，均系海河流域南系。除跨省、市大河外，市内有大于1000平方公里流域面积的较大支流两条。

　　一是新赵牛河，位于禹城南部，齐河西部，属徒骇河流域；二是六五河，位于陈公堤两侧，属漳卫新河流域，流域面积300～1000平方公里的支流有12条，其中徒骇河流域有苇河、四新河、管氏河、老赵牛河和邓金河，全部位于徒骇河之南；马颊河流域有笃马河、宋家河、宁津河、跃进河；德惠新河流域有禹临河、临商河、跃进河。除以上主要支流外，还有流域面积100～300平方公里的支流53条，30～100平方公里的114条，基本形成了干支相通，流域相连，能排能调的河流水利系统。

　　境内河流均属雨源型河流，其水量与上游地区及本市降水量分布极不均匀的气候特点密切相关。雨季雨量剧增，水位上涨，出现洪峰，甚至漫溢成灾，但到枯水期，多数河道先后断流、干枯巴巴。